0.9,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)。PPI網(wǎng)絡(luò)包含35個靶點以及121條邊(圖3A)。利用Cytoscape 3.7.1軟件的MCODE插件對該網(wǎng)絡(luò)進行聚類分析,共得到3個子網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)得分最高創(chuàng)建核心靶點網(wǎng)絡(luò)圖(圖3B)。核心靶標網(wǎng)絡(luò)(得分8.222)中的節(jié)點有:IL-6、IL-4、TNF、IL-1A、ICAM1、CCL2、CXCL8、IL-1B、IL-10和IFNG。">

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          基于網(wǎng)絡(luò)藥理學探討逍遙散“異病同治”抑郁癥、乳腺增生和功能性消化不良的作用機制(三)

          發(fā)布時間:2021-05-21 19:26 編輯者:特邀作者余秀梅

          2.3 關(guān)鍵靶點的查找以及關(guān)鍵活性成分的查找

          把38個共有靶點導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫,并設(shè)置interaction score>0.9,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)。PPI網(wǎng)絡(luò)包含35個靶點以及121條邊(圖3A)。利用Cytoscape 3.7.1軟件的MCODE插件對該網(wǎng)絡(luò)進行聚類分析,共得到3個子網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)得分最高創(chuàng)建核心靶點網(wǎng)絡(luò)圖(圖3B)。核心靶標網(wǎng)絡(luò)(得分8.222)中的節(jié)點有:IL-6、IL-4、TNF、IL-1A、ICAM1、CCL2、CXCL8、IL-1B、IL-10和IFNG。

          根據(jù)“單味藥-活性成分-共同靶點”相互作用網(wǎng)絡(luò)篩選得到的關(guān)鍵靶點搜尋到相應(yīng)的8個關(guān)鍵活性成分:槲皮素(MOL000098)、山柰酚(MOL000422)、β-谷固醇(MOL000358)、蘆薈大黃素(MOL000471)、Glyasperins M(MOL000354)、刺芒柄花素(MOL000392)、金合歡素(MOL001689)和柚皮素(M OL004328)。

          2.4 通路分析

          將上述獲得的逍遙散治療抑郁癥、乳腺增生和功能性消化不良的共同靶點輸入Metascape數(shù)據(jù)庫進行KEGG通路注釋分析。根據(jù)P<0.05對KEGG通路結(jié)果進行篩選,共得到17條相關(guān)通路,其中包括糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路 (AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、HIF-1信號通路 (HIF-1 signaling pathway)以及癌癥通路 (pathways in cancer)等通路(圖4A)。GO富集結(jié)果表明,在生物過程(biological process)中,逍遙散對脂多糖(response to lipopolysaccharide)、活性氧代謝 (reactive oxygen species metabolic process)以及細胞因子介導(dǎo)的通路 (cytokine-mediated signaling pathway)等的影響較大;在分子功能(molecular function)層面上,逍遙散對細胞因子 (cytokine receptor binding)、磷酸酶 (phosphatase binding)以及血紅素(heme binding)等的影響較大;在細胞組分(cellular component)中,逍遙散對膜筏 (membrane raft)、囊泡(vesicle lumen)以及核包膜 (nuclear envelope)的影響較大(圖4B)。

          聲明:本文所用圖片、文字來源《中國中藥雜志》,版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請與本網(wǎng)聯(lián)系刪除。

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